Los procariontes, se agrupa en un único reino: Bacteria, el cual tiene un subreino basal o ancestral: Negibacteria, de las bacterias gram-negativas, las cuales divirgieron por pérdida de la membrana externa en Posibacteria (gram-positivas) y estas a su vez en el clado (cada una de las ramas del árbol filogenético) Neomura, que finalmente dará origen a dos clados hermanos: Archaebacteria y Eukaryota, los cuales son mucho menos antiguos que las primeras bacterias.
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