sábado, 5 de diciembre de 2009
jueves, 3 de diciembre de 2009
Elements of the Differential and Integral Calculus - Granville, Smith
Cálculo Difencial e Integral - Granville. Este es todo un clásico en matemáticas, la únicas "desventaja" para algunos es que está inglés aunque las fórmulas sean las mismas en cualquier idioma. Click en la imagen para descargar.La canción de la PCR
There was a time when to amplify DNA
Hubo un tiempo en que para amplificar el ADN
You had to grow tons and tons of tiny cells.
Tenías que cultivar toneladas y toneladas de diminutas células
Then along came a guy named Dr. Kary Mullis,
Mucho tiempo después llegó un chico llamado Dr. Kary Mullis,
Said you can amplify in vitro just as well.
y dijo que podías amplificar in vitro igual de bien.
Just mix your template with a buffer and some primers,
Simplemente mezcla tu muestra con un buffer y algunos primers,
Nucleotides and polymerases, too.
nucleótidos y polimerasas,también.
Denaturing, annealing, and extending.
Desnaturalización, alineamiento y amplificación.
Well it’s amazing what heating and cooling and heating will do.
Bien, es sorprendente lo que el calentamiento, enfriamiento y calentamiento harán.
Chorus
PCR, when you need to detect mutations.
PCR, cuando necesites detectar mutaciones.
PCR, when you need to recombine.
PCR, cuando necesites recombinar.
PCR, when you need to find out who the daddy is.
PCR, cuando necesites saber quien es el papa.
PCR, when you need to solve a crime.
PCR, cuando necesites resolver un crimen.
GTCA
La verdad es que cuando vi este video no pude dejar de reirme. Muy divertido. El video empieza con el papá quejándose de que su hijo, "el negro", se paso estudiando 6 años para terminar haciendo eso... a lo que su esposa le dice "y tu ya no recuerdas que hacías lo mismo un tiempo atrás?"
GTCA Song
Randolph: Six years of graduate school, and look at our boy now.
Randolph’s Wife: Oh Randolph! Now I remember somebody who wasn’t too different from this not too long ago.
Enzyme, whatcha doin’ today?
I said enzyme, want to make DNA?
I said enzyme, show me your binding way
Let me mix you with some primers
Enzyme, time to build a new strand
I said enzyme, cause I know that you can
I said enzyme, these letters also spell DAN
All we need to get things started
Is just a little bit of GTCA
Is just a little bit of GTCA
I can build DNA
I can be a big star
You’re the key to my PCR
Thats right I’m talkin’ bout GTCA
Just a little bit of GTCA
I can make some new strands
I can view all my bands
I can be the best that I can
Enzyme, you have come a long way
But in my lab, demands are higher today
I said enzyme, now its time to go fast
We have got to increase throughput
Enzyme, I think I found what I need
It’s an enzyme, it gives me much higher speed
It goes so fast, when it builds DNA
All we need to get it started
Is just a little bit of GTCA
Is just a little bit of GTCA
I can build DNA
I can reach for the stars
I can do faster PCR
Yeeeeeaaaa-eeee-ehhh!
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To all the scientists out there doing PCR, Bio-Rad salutes you with the all new line of SsoFast Supermixes for real time PCR
Transposición genética
En 1950 Barbara McClintock realizó lo que se puede llamar un descubrimiento fundamental en el campo de la genética. Como suele suceder en estos casos, y a pesar de que sus experimentos y su lógica eran completamente inapelables, la mayoría de los científicos desestimaron las conclusiones por ser demasiado revolucionarias: “Esta mujer o está loca o un genio”, escribió el biólogo E. F. Keller. “Estaba tan sorprendida que pensé que me ridiculizarían, o me dirían que estaba realmente loca”, comentó la propia McClintock años más tarde. Solo 36 años más tarde la comunidad científica al completo celebró su descubrimiento cuando fue recompensada con el Nobel de Medicina, la única que no ha compartido el premio en esta categoría. Y todo porque sus teorías sobre ciertos elementos en los cromosomas del maíz han sido fundamentales para entender la genética, la evolución, la enfermedad y el cáncer.
¿Qué fue lo que descubrió? En la década de 1940 se dio cuenta de que había algo raro en la heredabilidad de ciertos elementos genéticos, pues no se ajustaban al patrón esperado. Después de años de experimentación McClintock descubrió el motivo: había segmentos de ADN en los cromosomas que se movían de un lugar a otro del genoma. Reciben el nombre de trasposones (antes “genes saltarines”) o elementos genéticos móviles. Así, si el elemento transponible está insertado en el interior de un gen, puede suceder que al moverse el gen recupere la función que tenía y estaba “cortocircuitada” por el trasposón. Del mismo modo, si al cambiar de posición se inserta dentro de un gen, se produce una adición de una gran cantidad de nucleótidos que provoca la pérdida de la función de dicho gen. En definitiva, los trasposones provocan un tipo peculiar de mutación, pues crean inestabilidad en el genoma al moverse libremente por él. Y el nuestro contiene alrededor de 3 millones de ellos, ¡casi la mitad de todo nuestro ADN! No es raro entonces que los científicos, cada vez que trabajan con genes, no dejen de encontrarse con todo tipo de transposones: das una patada a una piedra del genoma y salta un transposón.
En los años siguientes se descubrió que había dos tipos de estos elementos: los trasposones de McClintock (que componen el 2,8% del genoma humano) y los retrotrasposones (que se llevan el 42,8%). Estos elementos hacen una copia de ellos mismos en ARN que se “retrocopia” en ADN y se inserta en el genoma. Este comportamiento es muy parecido al de los retrovirus, como el del sida o el de la gripe.
Todos los retroelementos del ser humano parecidos a los virus se originaron hace decenas de millones de años, en la mayoría de los casos. No tenemos evidencias de retrovirus modernos instalándose comodamente en nuestro genoma y convirtiéndose en retrotransposones. Sin embargo, sí ha pasado en el resto de los mamíferos. Por ejemplo, chimpancés y gorilas poseen muchas copias de un retroelemento, descendientes de un retrovirus que infectó sus genomas de manera independiente pero no hizo lo propio con humanos y orangutanes. Otro tipo de retroelementos son trozos oportunistas de ADN que gracias a unas mutaciones han adquirido la habilidad de moverse libremente por el genoma.
El más común de todos es uno relativamente pequeño llamado Alu: cerca del 10% de genoma humano consiste en más de un millón de elementos Alu, uno de los pocos tipos de retrotransposones todavía activos en nuestro ADN. Su importancia a la hora de entender cómo ha funcionado la evolución es obvia: si dos individuos tienen insertado el mismo retroelemento en idéntica parte de su genoma, querrá decir que lo han debido heredar de un antepasado común. Esto es lo que se descubrió casi por accidente a mediados de 1980.
En 1985 científicos de la Universidad de California en Davis y Berkeley realizaron el primer estudio del ADN que rodea a los genes que codifican la hemoglobina, y lo compararon con el de los chimpancés. Como era de esperar encontraron muchos elementos Alu. Mas lo llamativo fue que todos ellos, sin excepción, se encontraron en los mismos lugares y con las mismas direcciones en ambas especies. Comparando las secuencias de ADN de 7 elementos Alu en chimpancés y humanos se vio que la similitud entre ambos iba del 94,7% al 98,9%. Solo 3 de 15 mutaciones daban cuenta de estas diferencias.
Otro ejemplo es HERV-K, un retrotransposón que se introdujo en el antepasado común de humanos, simios y monos hace decenas de millones de años, y al contrario que la mayoría de estos elementos parecidos a los virus, todavía está activo en nuestro genoma. Científicos del Instituto Shemyakin-Ovchinnikov de Química Bioorgánica de Rusia, descubrieron en 2000 que 11 de los 14 elementos presentes en los humanos se encuentran en la misma posición en chimpancés y gorilas, lo que nos dice que se trata de las especies más cercanas a la nuestra. La siguiente es el orangután, con el que compartimos 9 HERV-K, y el gibón, con 7. Con los monos del Viejo Mundo compartimos cuatro elementos y con los del Nuevo Mundo solo dos.
Vía| Masabadell
¿Qué fue lo que descubrió? En la década de 1940 se dio cuenta de que había algo raro en la heredabilidad de ciertos elementos genéticos, pues no se ajustaban al patrón esperado. Después de años de experimentación McClintock descubrió el motivo: había segmentos de ADN en los cromosomas que se movían de un lugar a otro del genoma. Reciben el nombre de trasposones (antes “genes saltarines”) o elementos genéticos móviles. Así, si el elemento transponible está insertado en el interior de un gen, puede suceder que al moverse el gen recupere la función que tenía y estaba “cortocircuitada” por el trasposón. Del mismo modo, si al cambiar de posición se inserta dentro de un gen, se produce una adición de una gran cantidad de nucleótidos que provoca la pérdida de la función de dicho gen. En definitiva, los trasposones provocan un tipo peculiar de mutación, pues crean inestabilidad en el genoma al moverse libremente por él. Y el nuestro contiene alrededor de 3 millones de ellos, ¡casi la mitad de todo nuestro ADN! No es raro entonces que los científicos, cada vez que trabajan con genes, no dejen de encontrarse con todo tipo de transposones: das una patada a una piedra del genoma y salta un transposón.
En los años siguientes se descubrió que había dos tipos de estos elementos: los trasposones de McClintock (que componen el 2,8% del genoma humano) y los retrotrasposones (que se llevan el 42,8%). Estos elementos hacen una copia de ellos mismos en ARN que se “retrocopia” en ADN y se inserta en el genoma. Este comportamiento es muy parecido al de los retrovirus, como el del sida o el de la gripe.
Todos los retroelementos del ser humano parecidos a los virus se originaron hace decenas de millones de años, en la mayoría de los casos. No tenemos evidencias de retrovirus modernos instalándose comodamente en nuestro genoma y convirtiéndose en retrotransposones. Sin embargo, sí ha pasado en el resto de los mamíferos. Por ejemplo, chimpancés y gorilas poseen muchas copias de un retroelemento, descendientes de un retrovirus que infectó sus genomas de manera independiente pero no hizo lo propio con humanos y orangutanes. Otro tipo de retroelementos son trozos oportunistas de ADN que gracias a unas mutaciones han adquirido la habilidad de moverse libremente por el genoma.
El más común de todos es uno relativamente pequeño llamado Alu: cerca del 10% de genoma humano consiste en más de un millón de elementos Alu, uno de los pocos tipos de retrotransposones todavía activos en nuestro ADN. Su importancia a la hora de entender cómo ha funcionado la evolución es obvia: si dos individuos tienen insertado el mismo retroelemento en idéntica parte de su genoma, querrá decir que lo han debido heredar de un antepasado común. Esto es lo que se descubrió casi por accidente a mediados de 1980.
En 1985 científicos de la Universidad de California en Davis y Berkeley realizaron el primer estudio del ADN que rodea a los genes que codifican la hemoglobina, y lo compararon con el de los chimpancés. Como era de esperar encontraron muchos elementos Alu. Mas lo llamativo fue que todos ellos, sin excepción, se encontraron en los mismos lugares y con las mismas direcciones en ambas especies. Comparando las secuencias de ADN de 7 elementos Alu en chimpancés y humanos se vio que la similitud entre ambos iba del 94,7% al 98,9%. Solo 3 de 15 mutaciones daban cuenta de estas diferencias.
Otro ejemplo es HERV-K, un retrotransposón que se introdujo en el antepasado común de humanos, simios y monos hace decenas de millones de años, y al contrario que la mayoría de estos elementos parecidos a los virus, todavía está activo en nuestro genoma. Científicos del Instituto Shemyakin-Ovchinnikov de Química Bioorgánica de Rusia, descubrieron en 2000 que 11 de los 14 elementos presentes en los humanos se encuentran en la misma posición en chimpancés y gorilas, lo que nos dice que se trata de las especies más cercanas a la nuestra. La siguiente es el orangután, con el que compartimos 9 HERV-K, y el gibón, con 7. Con los monos del Viejo Mundo compartimos cuatro elementos y con los del Nuevo Mundo solo dos.
Vía| Masabadell
Micologia Medica Ilustrada - Roberto Arenas - 3° ed
Titulo: Micología Médica Ilustrada
Autor: Roberto Arenas
Paginas: 423
Edición: 3ª
Año: 2008
Formato: PDF
Idioma: Español
Tamaño: 80MB
Descripcion del Libro
Tercera edición del best seller que incluye lo esencial y lo práctico de la micología actual, partiendo de los datos históricos más sobresalientes.
Incluye las principales características de los diferentes tipos de hongos y su proceso evolutivo, así como morfología microscópica. Aborda las micosis superficiales, subcutáneas y sistémicas, medicamentos, medios de tinción, reactivos y colorantes con un glosario de los términos más importantes.
Está estructurado para su fácil comprensión a través de un sistema de definición, datos epidemiológicos, etiopatogenia, cuadro clínico, estudio micológico, datos de laboratorio, diagnóstico diferencial, tratamiento y pronóstico.
Incluye nuevo material iconográfico y actualidades en organismos y tratamientos farmacológicos.
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Comparar el tamaño de las cosas
Para ayudarnos al comparar tamaños muy pequeños, en Learn Genetics de la Universidad de Utah han publicado una infografía interactiva que permite, al hacer zoom, comparar tamaños entre un grano de café (12x8 mm) y un átomo de carbono (140 pm) pasando por un grano de arroz, un espermatozoide, un cromosoma X, un VIH y una molécula de agua, entre otros.
Vía| D01
Physarum en un laberinto
Que pasaría si se pone a una colonia de Physarum en un laberinto, será capaz de encontrar la forma más rápida de llegar hasta el final, donde lo espera su recompensa? Este experimento lo hizo el artista Heather Barnett quien, usando la técnica del stop motion, pudo observar el comportamiento de este hongo.
Vía|BioUnalm
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